Die meisten Atemtherapien werden sowohl zur Förderung des allgemeinen Wohlbefindens als auch zur Behandlung bestimmter psychologischer, physischer und/oder spiritueller Zustände eingesetzt. Zu den allgemeinen Vorteilen gehören Stressabbau, erhöhte Energie und Vitalität und (im Fall von Yoga und anderen ähnlichen Praktiken) erhöhte Flexibilität.
Atemphysiotherapie wurde auch zur Behandlung einer Vielzahl spezifischer Beschwerden eingesetzt, wie z. B. Asthma, Bluthochdruck, Kopfschmerzen und rheumatoide Arthritis. Atemübungen haben bereits vielen Kindern geholfen, Asthmaanfälle zu vermeiden und die Lungenfunktion zu verbessern. Integrative Atemtherapie wurde eingesetzt, um Wut, Erschöpfung, Feindseligkeit und das Risiko neuer Herzprobleme bei einigen Menschen, die eine Herzoperation hinter sich haben, zu reduzieren.
Viele klinische Studien der letzten Jahrzehnte haben spezifische Vorteile in Verbindung mit verschiedenen Atemtechniken und/oder atembasierten Therapien gezeigt, insbesondere bestimmte Arten von Yoga und Meditation.